近日,陜西省西安植物園植物多樣性監(jiān)測(cè)與保護(hù)團(tuán)隊(duì)在學(xué)術(shù)期刊Agronomy(IF=3.7,中科院二區(qū))在線發(fā)表了研究論文,表明蔊菜屬質(zhì)體基因組(圖1)在基因數(shù)量和順序、總長(zhǎng)度、基因組結(jié)構(gòu)、密碼子使用、長(zhǎng)重復(fù)序列和SSR方面是保守的;14個(gè)突變熱點(diǎn)區(qū)可作為區(qū)分該屬植物的候選DNA條形碼;基于質(zhì)體基因組和nrDNA ITS序列的系統(tǒng)發(fā)育樹也清晰地表明,10個(gè)蔊菜屬物種在碎米薺族(Cardamineae)內(nèi)呈現(xiàn)出單系(圖2)。

  另外,研究者還發(fā)現(xiàn)蔊菜屬內(nèi)的種間關(guān)系及與近緣屬的屬間關(guān)系存在明顯的核質(zhì)不一致,為此推斷這種核質(zhì)不一致很可能是蔊菜屬內(nèi)的種間雜交及與近緣屬的屬間雜交的結(jié)果。

  這些質(zhì)體基因組為蔊菜屬的物種鑒定、進(jìn)化歷史和系統(tǒng)發(fā)育研究提供了新的信息。

圖1蔊菜屬質(zhì)體基因組圖譜

圖2 基于質(zhì)體蛋白編碼基因和nrDNA ITS序列推斷蔊菜屬的系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系

  蔊菜屬(Rorippa)由約75種組成,隸屬于十字花科(Brassicaceae)。該屬物種主要生長(zhǎng)在北半球,除南極洲外,其他大陸均有分布。目前蔊菜屬的分類和系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系仍不確定,主要是由頻繁的雜交事件引起的該屬?gòu)?fù)雜的形態(tài)變異造成的。

  任婷博士為論文第一作者,黎斌研究員為論文通訊作者,尋路路和賈蕓參與相關(guān)研究工作,陜西省西安植物園(陜西省植物研究所)為第一完成單位。本研究得到了陜西省科學(xué)院科技計(jì)劃項(xiàng)目(2023K-25,2023K-48,2023K-14)和國(guó)家自然科學(xué)基金(32300314)的資助。

  原文鏈接:https://doi.org/10.3390/agronomy14050913

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